南京医科大学图书馆始建于1 9 3 4 年, 是江苏高等教育文献保障系统（JALIS）的医学文献中心、中国高等教育文献保障系统（CALIS）的成员馆、江苏省工程技术文献信息中心的成员馆、江苏省医药卫生中心馆、中国学术期刊文献检索一级咨询站。

图书馆建筑面积约2.2万平方米，有五台校区和江宁校区二处馆舍，设有阅览座位2000余席。实行“大开间，全开架，查、阅、借、藏一体化”的“大开放”的服务模式，阅览室每周开放105小时，全天24小时开放网上资源。在借阅服务基础上，开展代查代检及原文传递服务；查收查引、查新服务；学科服务及定题服务；各类信息资源培训服务等。

馆藏书刊以基础医学、临床医学、口腔医学、预防医学、药学、生物学为收藏重点，同时收藏化学、数学、物理学、计算机、管理学、社会科学及文艺类书刊等。目前纸质图书150余万册，数据库103个，中、外文电子图书（含学位论文）1000万余册，中、外文全文电子期刊约76万余册。

图书馆坚持“读者为本”的服务理念，以“服务读者人性化、资源利用最大化、规范管理科学化”为指导思想，以数字图书馆建设为方向，努力为学校的人才培养、科学研究、文化交流及服务社会发挥不可替代的作用。